У всіх частинах рослини містяться дубильні речовини, кумарини, халкони, флавоноїди, фенолглікозіди гаультерін (близько 0,03%). Крім того, в траві містяться саліцилати, ізоаміламін, аскорбінова кислота, ефірна олія та інші сполуки.
Препарати комірника шестілепестная мають в'язким, потогінну, сечогінну, дезінфікуючу і кровоспинну властивостями. Коріння рослини входять до складу мікстури М. Здренко, що вживається при папилломатозе сечового міхура, анацидном гастриті, виразці шлунка і геморої.
У народній медицині настоянка на горілці застосовується при шлункових захворюваннях.
У народній медицині застосовується при захворюваннях:
- дихальної системи;
- шкіри;
- чоловічих;
- нервової системи;
- онкологічних;
- опорно-рухового апарату;
- травної системи;
- серцево-судинної системи;
- ендокринної системи.
- дифузно-токсичному і інших видах зоба.

Гадючник звичайний - при гастриті, виразці кишечника, геморої, захворюваннях сечового міхура 1 столову ложку подрібнених коренів залити 200 мл окропу, нагрівати на водяній бані 10 хвилин, настояти 2 години, процідити. Приймати по 1 столовій ложці 4 рази на день. Настоянка. При раку шлунка 100 грам подрібненого кореня залити 1 літром горілки, настояти 3 тижні в темному місці, періодично збовтуючи, процідити. Приймати по 1 чайній ложці 3 рази на день, розбавляючи водою. Курс - 3 місяці. При захворюваннях нирок, сечового міхура, ШЛУНКОВО-кишкового тракту, при серцевій недостатності, шкірних захворюваннях, епілепсії, маткових кровотечах, виразкової хвороби шлунка, укусах скажених собак, при сечокам'яної хвороби, мігрені, геморої, остехондрозах, подагрі, ревматизмі 2 чайні ложки подрібненого кореня залити 1 склянкою окропу, настояти в термосі 5 годин, процідити. Приймати по 1 столовій ложці 5-6 разів на день, перед їдою. При ревматизмі, подагрі, захворюваннях сечовивідних шляхів і нирок, розладах ШЛУНКОВО-кишкового тракту, простудних захворюваннях, набряках, нервових розладах 1 чайну ложку подрібнених коренів залити 1 склянкою холодної кип'яченої води, настояти 8 годин, процідити. Випити весь настій маленькими ковтками протягом дня. При папіломатозі сечового міхура, анацидному гастриті, виразковій хворобі шлунка 1 чайну ложку подрібнених коренів залити 2 склянками окропу, нагрівати на киплячій водяній бані 30 хвилин, процідити гарячим. Приймати по 1 столовій ложці 3 рази в день після їжі. При раку різної локалізації 1 столову ложку подрібнених коренів залити 1 склянкою окропу, варити на водяній бані 30 хвилин, настояти 10 хвилин, процідити. Приймати по 1/4 склянки 3-4 рази на день, до їди. Спринцювання. При білях 20 грам подрібнених коренів залити 1 літром окропу, варити в закритому посуді на киплячій водяній бані 30 хвилин, настояти до охолодження (до температури тіла), процідити. Спринцюватися теплим відваром 1 раз на день, на ніч. Ванни. При ішіасі 2 столові ложки подрібнених коренів залити 1 літром води, кип'ятити 30 хвилин, настояти 30 хвилин, процідити. Вилити відвар у ванну з температурою води 36-37°С, тривалість процедури 15-25 хвилин. Настоянка. Зовнішньо. При подагрі, ревматизмі 10 грам подрібненого коріння залити 100 мл 70% спирту, настояти 21 день в темному місці, періодично збовтуючи, процідити. Розтирати настоянкою хворі місця 1-3 рази в день. При проносах, геморої 1 столову ложку подрібнених коренів залити 250 мл води, кип'ятити 10 хвилин в закритому посуді, настояти 1 годину, процідити. Приймати по 1 столовій ложці 3-4 рази на день, до їди. при ревматизмі, подагрі 15 грам подрібнених квіток залити 1 літром окропу, настояти 3 години, процідити. Приймати по 1/4 склянки 4 рази на день, до їди. При раку різної локалізації, як профілактичний засіб лікування передракових змін 1 столову ложку подрібнених квіток залити 1 склянкою окропу, варити на киплячій водяній бані 30 хвилин, настояти 10 хвилин, процідити. Приймати по 1/4 склянки 3-4 рази на день, за 30 хвилин до їжі. При раку простати 1 столову ложку подрібнених квіток залити 1,5 склянками окропу, настояти 4 години, процідити. Одержаний настій розділити на 3 частини. Приймати по 1 частини 3 рази на день, перед їдою.